Николай Иванович погиб 1 июля 2019 года во время нештатной аварийной ситуации на атомной глубоководной станции. Всего в результате аварии погибло 14 членов экипажа корабля. Благодаря самоотверженным действиям экипажа, ценой своих жизней источник аварийной ситуации был ликвидирован, подводный корабль был спасён. За 40 лет военной службы Николай Иванович Филин прошёл боевой путь от курсанта